Jeune homme discret, Jake est appelé en urgence chez Abe, son grand-père, qu'il adore. Arrivé sur place à la nuit tombée, Jake retrouve Abe dans un bois tout proche, un couteau ensanglanté dans la main. Avant de rendre son dernier souffle, Abe lui tient des propos incohérents et lui demande de se rendre au pays de Galles, sur une île semble-t-il chargée de mystères où il y aurait un foyer pour enfants dirigé par une certaine Miss Peregrine. L'établissement qu'Abe lui dit avoir fréquenté abriterait de jeunes gens aux pouvoirs extraordinaires. Jake décide de s'y rendre