À travers les témoignages d'experts mais aussi de proches des victimes, «Indices» déroule le fil d'enquêtes criminelles afin de comprendre comment elles ont été résolues. 22 juillet 2001. Karine Schaaff, 17 ans, décide de se rendre à vélo chez une amie. Elle n'a que quelques kilomètres à parcourir, mais pourtant, elle n'arrivera jamais à destination.