Un petit Pokémon à l'air triste atterrit dans les cheveux de Clem, et nos héros sont bien déterminés à découvrir ce qui ne va pas ! Son dresseur, Fabien, explique que ce petit Flabébé est très lié à son épouse, Florence. Mais elle est tombée malade, et, lorsque Flabébé a voulu lui rendre visite à l'hôpital, une voiture qui passait a écrasé sa fleur ! Sans sa fleur, Flabébé s'affaiblit, mais il n'en veut aucune autre : il a besoin d'une Fleur Fée, et ces fleurs sont très difficiles à trouver ! Nos héros se lancent à la recherche de la fameuse fleur, «aidés» par la Team Rocket, déguisés en guides touristiques.